、红线草群落、亮叶眼子菜群落、丝状绿藻群落和轮藻、丽藻植物群落等8个群落类型。挺水植物群落主要分布在水深0.3 ～1米的河口两侧或湖湾、浅滩及沼泽的洼地中，一般底质有较厚的淤泥；浮叶植物群落在泸沽湖很不发达，仅在湖湾或湖区局部水域零星分布；沉水植物群落主要分布在水深为1～10米的湖湾及村庄附近水域，分布最深的为轮藻属和丽藻属植物。沉水植物群落在泸沽湖非常发达，不但种类多，生物量大，而且分布宽度也远大于浮水和挺水群落类型，占绝对优势。

2013年7月和2014年4月的调查结果表明，泸沽湖水陆交错带大型水生植物较为丰富，共计39种，隶属24科，其中包括蕨类植物2种，占总种类的5.3%；单子叶植物29种，占74.4%；双子叶植物7种，占18.9%；以及轮藻类植物（包括轮藻和丽藻）。按照水生植物的生活型，挺水植物为13种，占33.3%，分属于禾本科、莎草科等7科；漂浮植物为2种，占5.1%，分属于浮萍科和满江红科；浮叶植物6种，占15.4%，分属于龙胆科、眼子菜科等6 科；沉水植物18种，占46.2%，分属于轮藻科、眼子菜科、茨藻科和水鳖科等9科。

泸沽湖大型水生植物沿湖岸带呈环带状分布，面积约为824.47公顷，占湖泊总面积的14.7%，若去除草海部分，大型水生植物分布面积约为263.26公顷，占湖泊总面积的4.7%。从三大类植物群落类型来看，沉水植物分布面积占96.1%，浮叶和漂浮植物分布面积占2.7%，挺水植物分布面积占1.2%。

动物

泸沽湖水圈属半封闭生态环境，动物种类多样。泸沽湖保护区鱼类组成为3目4科12种，4种是泸沽湖的原生种：厚唇裂腹鱼、宁蒗裂腹鱼、泸沽湖裂腹鱼、泥鳅，特有种3种：厚唇裂腹鱼、宁蒗裂腹鱼、小口裂腹鱼，其他8种为次生的鲤鱼、草鱼、麦穗鱼、银鱼、鲫鱼等。关于泸沽湖鱼类问题，就裂腹鱼而言，过去尚有“白条子”、“白砸嘴’’、“厚大嘴巴鱼”、“薄大嘴巴鱼”、“蛇鱼’’、“青鱼”、“吃草细鳞鱼”等六、七个品种，据描述在食性、水域、体型、肤色、个体重量等方面均有差别。 3种裂腹鱼经济价值较高，但年产量急剧下降，20世纪50年代年捕捞量为300吨，80年代下降到30吨，90年代降至2吨左右。泸沽湖鱼类组成情况是：泸沽湖鱼类有15种，隶属5目6科，2004年泸沽湖鱼类外来物种为8种，到2014年泸沽湖鱼类外来物种增加到11种。由于11个鱼类外来物种逐步进入了泸沽湖，湖中鱼类区系已由外来物种控制，3种特有的裂腹鱼种濒临商业灭绝。综观泸沽湖鱼类区系的特点是：种类贫乏，个体较小，生长稍慢，这也是云贵高原湖泊的共同特点。泸沽湖流域自然环境适宜，水量充沛、水质极好、发展渔业有一定的有利条件。泸沽湖鱼类区系的特点具有种类贫乏，个体较小，生长稍慢的特点。正是这些特点，决定了湖泊渔产的低下性能，基本上泸沽湖年鱼产量都在百吨左右。泸沽湖鱼类饵料生物组成及生物量也决定了渔产量不高，通过泸沽湖主要鱼类生物学的分析表明，低产原因除了鱼类本身固有的属性外，还有鱼类饵料生物的种类和数量及其再生产的能力不相适应的因素。

水系构成编辑

上游水系

泸沽湖入湖河流共18条（云南部分11条，四川部分7条），其中常流河共9条（云南部分5条，四川部分4条），分别为大渔坝河、乌马河、幽谷河、王家湾河、蒗放河、凹垮河、蒙垮河、大嘴河、八大队河。流入湖的山泉主要有三家村附近山溪、小鱼坝山溪、洛水行政村附近大鱼坝山溪等。泸沽湖，流入湖的山泉主要有三家村附近山溪、小鱼坝山溪、洛水行政村附近大鱼坝山溪等。除上述泉水外，湖水主要靠雨水补给。泸沽湖流域的降水量略高于该湖流域的外围地区，多年平均降水量约为1000毫米。其中全年降水量的89%集中在6～10五个月。由于泸沽湖的集水面积不大，故入湖河道都十分短小，较大的有由东岸汇入的山垮河和南岸汇入的三家村河。临时性的沟溪汇水和区间坡面漫流是湖水补给的一种主要形式。

湖水补给除雨量和四川泉水外，主要在于泸沽湖自身的地下水。泸源崖就是泸沽湖地下水的出水口所在地。

泸沽湖湖水的出口在东岸，每年6～10月份，湖水经东侧的大草海注入前所河，再注入盖祖河（下游称永宁河），再注入卧龙河（又名卧落河、盐源河），入流理塘河，最后排入长江上游干流段金沙江的支流雅砻江。

泸沽湖为海陆水循环，属长江上游的金沙江水系，路径是：降水（地表和地下径流）≥泸沽湖≥湖水出口（位于湖泊东南面的草海）≥盖祖河≥雅砻江≥金沙江≥长江≥东海（太平洋）。泸沽湖的丰水期集中在每年的6至10月，只有丰水期湖水才会由地表河道将水排出湖外，其他时间排水河道流量很小甚至无流量。除地表江河出水外，泸沽湖的溶蚀