家被灭族，导致整个朝廷大量的官位空缺。最后，新设了十二个县，也需要人去治理。

为了应对这种情况，陈玉齐采取了三种措施。第一，大量提拔寒门子弟。改革科考内容，增加了很多实用性科目。第二，在甄别之后，大量使用巫山国，北巷国原官吏。不过官职都改变了，有些人才直接提拔到了中央。第三，就是将西川军，军中的读书人转成了文官。

另外，陈玉齐歼灭了西川境内的所有私属武装，特别是皇室成员养士，陈玉齐是毫不客气的用炮轰。另外，整编了全国军队。对立功军人给予了封赏，对违法乱为的，严厉惩罚。